Sekolah Tinggi mempunyai misi:
- Menyelenggarakan pendidikan yang unggul dan inovatif dalam kajian Kependidikan Islam.
- Mewujudkan tata kelola kelembagaan yang unggul berstandar nasional
- Menghasilkan penelitian yang unggul di bidang pendidikan berbasis kearifan lokal.
- Menyelenggarakan Pengabdian yang bermanfaat untuk kepentingan ilmu pengetahuan, Islam dan masyarakat.